Shirō è il carattere principale della storia, un adolescente serio ed onesto sempre felice di aiutare gli altri. È al suo secondo anno della scuola superiore ed i suoi hobby includono la riparazione di una varietà di cose rotte, da televisori a stufe ecc..
Ha una buona capacità nella magia detta di rinforzo, benchè il suo padre adottivo Kiritsugu Emiya non lo abbia incoraggiato a migliorarsi troppo. Inizialmente, è molto confuso sulla guerra santa del Graal ed irrazionalmente tenta di proteggere gli altri, persino il suo proprio Servant Saber dal pericolo.
Circa dieci anni fa durante la conclusione della quarta guerra Santa del Graal, la città di Fuyuki fu consumata da un incendio violento. Le fiamme rasero al suolo gran parte della città e provocarono molte perdite, comprese quelle dei veri genitori di Shirō. Scampato alle fiamme, sul punto di morte e disposto a soccombere alle sue lesioni incontrò Emiya Kiritsugu. Kiritsugu, motivato dalla sua pietà e dal dolore causato prese con se il ragazzo accettandolo come figlio adottivo. Kiritsugu cercò sempre di tenere il figlio lontano da ogni principio di magia, fortunatamente Emiya non mostrava alcuna capacità nell'eseguire neanche i più semplici sortilegi, tranne una modesta capacità nella magia di rinforzo, magia peraltro poco utilizzata ed alla quale anche i più potenti maghi davano poca importanza.
Kirigutsu allevò il figlio seguendo la sua filosofia, ognuno doveva cercare sempre di aiutare il prossimo anche mettendo a repentaglio la propria vita ed Emiya vedeva nel padre un chiaro esempio di tutto ciò che lo stesso cercava di insegnargli. Un giorno però Kirugutsu morì misteriosamente, lo sconforto prese Emiya ma la presenza della sua vicina e maestra di inglese Taiga Fujimura, e della giovane Sakura Matō aiutò il giovane Emiya ad andare avanti ed a continuare la propria vita sempre seguendo l'ideologia del padre.
Malgrado la sua povera attitudine per i sortilegi, Shirō usò le sue abilità come aiuto nel riparare vari macchinari ed oggetti. Seguendo le aspirazioni del padre egli spera tutt'ora che migliorando la sua sola tecnica possa realizzare il sogno di Kiritsugu di essere "un Eroe della giustizia"

Abilità particolare: all'inizio l'unica abilità in cui Emiya eccelle è la magia detta di rinforzo, un potere che gli consente di analizzare la struttura degli oggetti e di aumentarne la forza dei materiali stessi, ma il continuo allenamento lo porta a scoprire successivamente un ulteriore potere che è la magia di tracciamento mediante la quale Emiya è in grado di ricreare tra le sue mani qualsiasi cosa gli passi per la testa.

Inviato da Onikurai