Studenti dell'Accademia = I bambini che aspirano a diventare ninja e che devono superare un esame elementare per passare a genin. In genere conoscono solo poche tecniche base, l'utilizzo di qualche arma leggera e qualche nozione di teoria, come la storia del villaggio in cui vivono, che gli viene insegnata nell'accademia.

Genin = Sono considerati Genin gli apprendisti ninja, che hanno superato l'esame dell'accademia. Devono sottostare agli ordini di un Jonin incaricato di insegnare loro tecniche più complesse. Eseguono solo missioni di tipo D e, per passare di grado, devono affrontare l'esame per diventare Chunin.

Chunin = I Chunin sono considerati ninja di medio livello, che eseguono missioni di tipo B e C. Il passaggio da Genin a Chunin è molto grande, poichè i Chunin devono essere capo-gruppo di alcuni ninja alle prime armi.

Jonin = Il livello di "Jonin" segna il raggiungimento di un'elevata abilità da parte di un ninja. Sono considerati Jonin solo i ninja veterani. A ogni Jonin vengono affidati alcuni Genin per poterli istruire al meglio. Possono essere anche insegnati privati di alcuni ninja promettenti e che potrebbero diventare futuri Hokage. Eseguono missioni di tipo B e C per allenarsi e, talvolta, anche missioni di tipo A. Spetta a loro il compito di difendere, se necessario, il villaggio dagli eventuali attacchi nemici. Inoltre alcuni di essi vengono scelti come esaminatori durante l'esame per diventare Chunin.

Jonin Speciali = Ninja speciali ai quali è affidato un compito specifico (spesso si tratta di un assassinio). Sono presenti in questa categoria anche i membri della squadra speciale, specializzati in vari compiti, come quello medico. Anche i jonin specializzati nella tortura e nell'interrogatorio sono necessariamente jonin speciali.Questi ninja speciali talvolta indossano una mascherina di animale per non farsi riconoscere.

Kage = Gli Hokage sono l'Elite dei ninja del villaggio, cioè i guerrieri più forti ed esperti. Eseguono missioni di tipo A e B.
I Kage sono i ninja più potenti di ogni villaggio, che regnano su tutti gli altri ninja. La loro forza è enorme e la loro saggezza non ha confini.
I cinque kage dei villaggi ninja più potenti sono:
Hokage - Villaggio della Foglia
Mizukage - Villaggio della Nebbia
Raikage - Villaggio della Nuvola
Kazekage - Villaggio della Sabbia
Tsuchikage - Villaggio della Roccia

Sennin =I tre ninja leggendari (detti anche "Sennin" o "Sannin") sono Jiraiya, Orochimaru e Tsunade. Allievi di Sarutobi (il Terzo Hokage), si distinsero per le loro grandi capacità di ninja e ben presto ottennero il titolo di jonin.
Successivamente abbandonarono il villaggio e di loro si ebbero ben poche notizie.
Orochimaru stava preparando la guerra contro il villaggio della foglia, verso il quale provava un sentimento di odio profondo perchè la sua proposta di diventare Hokage fu rifiutata insieme a Kabuto e altri ninja, Tsunade era sparita dopo la morte del suo fratellino e del suo fidanzato e Jiraiya era in cerca di... belle donne! Quando il piano di Orochimaru si concretizza e inizia la guerra nel villaggio della foglia, ricompare Jiraiya a dare man forte a Naruto e soci.
Tsunade, invece, riappare quando Jiraiya le propone in nome di tutto il villaggio della foglia di diventare Hokage, mentre Orochimaru le fa una proposta: guarirgli le braccia, distrutte dal Terzo Hokage durante un duro scontro, in cambio della resurrezione, grazie ad una sua tecnica proibita, di suo fratello e del suo fidanzato, ai quali era molto legata.
Insomma, le strade dei tre ninja leggendari sono destinate ad incrociarsi sempre.
curiosità
Ad ognuno di loro è associato un animale:
Jiraiya - Rospo
Orochimaru - Serpente
Tsunade - Lumaca

Questi tre animali, insieme, formano il Sansukumi, un gioco giapponese molto simile alla Morra Cinese (Janken): il rospo batte la lumaca, la lumaca batte il serpente ed il serpente batte il rospo.

I loro nomi provengono dalla novella Jiraiya Goketsu Monogatari (La storia del coraggioso Jiraiya) dove il protagonista è, appunto, Jiraiya, un pirata in grado di utilizzare delle rane magiche, che si sposa con Tsunade, una giovane donna esperta nell’uso di lumache magiche. Infine uno dei seguaci di Jiraiya, Yashagoro, diventa suo nemico e cambia il suo nome in Orochimaru.